BPC-157, TB-500, GHK-Cu, CJC-1295, Semax : les noms de peptides semblent suivre un système, mais ce système n'existe pas. Certains noms sont littéralement la séquence, d'autres sont un code de programme dont vous ne pouvez rien lire. Ce guide montre quelles informations figurent dans un nom et lesquelles n'y figurent pas.
Les noms de peptides proviennent de deux mondes différents : notation systématique, où les lettres sont les acides aminés (GHK = Gly-His-Lys), et codes de programme comme BPC-157, dont la séquence ne peut pas être dérivée. Des suffixes tels que -NH2 et des préfixes tels que Ac- sont de véritables informations chimiques.
Notation systématique : les lettres sont les acides aminés
En notation systématique, chaque lettre ou abréviation représente un acide aminé, et le sens de lecture va toujours de l'extrémité N à l'extrémité C. Deux codes coexistent : le code à trois lettres (Gly-His-Lys) et le code à une lettre (GHK). Même chaîne, orthographe différente.
GHK-Cu est donc un nom que vous pouvez décompresser : glycine, histidine, lysine, plus un ion cuivre lié. Pour la liaison entre ces acides aminés, voir qu'est-ce qu'une liaison peptidique; les peptides de cuivre en général sont couverts par peptides de cuivre.
Codes de programme : des noms qui ne disent rien sur la structure
BPC-157, TB-500 et CJC-1295 sont des désignations issues d'un programme de recherche : les lettres indiquent la famille de composés ou la piste de développement, le numéro est un code interne. La longueur, la séquence et le poids moléculaire ne peuvent pas être retracés à partir d'un tel nom — pour cela, vous avez besoin des spécifications ou du certificat d'analyse.
Parfois, il y a un indice. Le TB dans TB-500 indique Thymosin Beta, la famille de protéines dont dérive le fragment ; voir qu'est-ce que le TB-500. Mais c’est une indication sur l’origine, pas une description de la molécule. Des noms comme Semax et Selank ont simplement été donnés par leurs développeurs.
Préfixes et suffixes qui signifient quelque chose
Là où le nom lui-même peut être arbitraire, les modifications à la fin ne le sont pas : celles-ci sont là à titre d'information chimique. A -NH2 à la fin signifie une extrémité C amidée au lieu d'un groupe carboxyle libre. Un Ac- à l'avant signifie une extrémité N-terminale acétylée. Les deux modifient le comportement de la molécule, la stabilité entre autres.
Une notation comme (1-29) indique un fragment : uniquement les acides aminés 1 à 29 de la protéine d'origine. Et où un D- apparaît avant un acide aminé, la forme image miroir a été utilisée à la place de la forme L naturelle – une intervention souvent destinée précisément à ralentir la dégradation.
Pourquoi c’est important dans la pratique
Parce que deux produits portant à peu près le même nom peuvent être des molécules différentes, et qu’une molécule peut circuler sous plusieurs noms. La seule chose qui fixe l’identité est la séquence ou la masse mesurée, et non l’étiquette. Ainsi, le poids moléculaire et la séquence figurent dans les spécifications de nos pages produits, et la valeur mesurée par lot sur la page certificat.
Le fonctionnement de cette mesure est en qu'est-ce que la spectrométrie de masse; le côté pureté dans qu'est-ce que la HPLC. En recherchant par nom, le Indice peptidique A-Z est le point de départ le plus rapide.
Ces informations sont de nature générale et pédagogique. LYSENTA fournit des peptides de recherche à des fins de laboratoire et de recherche uniquement. Non destiné à la consommation humaine ou animale, ni médicament ni avis médical.
Questions fréquemment posées sur les noms de peptides
Pourquoi les peptides sont-ils appelés BPC-157 ou CJC-1295 ?
Ces noms sont des codes de programme et non des descriptions chimiques. Les lettres indiquent le programme de recherche ou la famille de composés dont est issue la substance ; le numéro est un indicateur interne. Vous ne pouvez pas déduire la séquence d'un tel nom.
Que signifie GHK dans GHK-Cu ?
GHK sont les codes à une lettre des trois acides aminés de la chaîne : glycine (G), histidine (H) et lysine (K). Cu est le symbole du cuivre, l'ion lié au tripeptide. Ici, le nom est vraiment la séquence.
Que signifie -NH2 après le nom d'un peptide ?
Que l'extrémité C-terminale est amidée au lieu de porter un groupe carboxyle libre. Il s'agit d'une modification chimique qui affecte la stabilité de la molécule ; Ac- au début indique une extrémité N-terminale acétylée de la même manière.
Quand quelque chose est-il un peptide et quand une protéine ?
La distinction est une convention et non une loi de la nature. Les chaînes comprenant jusqu'à une cinquantaine d'acides aminés sont généralement appelées peptides, les chaînes plus longues étant polypeptides ou protéines. La liaison chimique entre les acides aminés est la même dans les deux cas.
